蛋白质组学技术在课题设计及基金申请的解决方案

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发布者:上海玮瑜生物科技有限公司
发布时间:2016-11-03
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  • 2017年1月7-8日(上海)   
     
      
  • 蛋白质组学技术在课题设计及基金申请的解决方案学习班
    邀请函
  • 课程背景
        目前,高通量的基因组、转录组学技术非常成熟,能大规模的对样品DNA和RNA进行分析,筛选到成千上万的差异表达基因。但是有一个核心的问题,即DNA/RNA的水平与蛋白质的水平没有正相关性(<30%),导致在基因层面上筛选到差异表达基因往往不能映射到蛋白质水平;此外,蛋白质区别于DNA/RNA的另一个显著特性—翻译后修饰(磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化、SUMO化等),蛋白质翻译后修饰往往会影响/改变蛋白质的活性和功能。蛋白质的翻译后修饰显然无法在DNA和mRNA水平上进行检测。
        现在是后基因组时代。绝大多数的生物学/医学的学术文章,都要求做到蛋白质水平。鉴于DNA/RNA与蛋白质的诸多差异,直接从蛋白质水平入手,对样品进行分析是大势所趋。LC-MS为基础的蛋白质组学技术的快速发展,为蛋白质的高通量分析和后续特定蛋白质的深入功能解析提供了强有力的技术保障,其突出优势体现在:(1)高通量地对未知蛋白质样品进行分析,能一次从样品中鉴定到成千上万种蛋白质;(2)真正做到有的放矢。通过LC-MS分析,能一目了然地知晓样品中的蛋白质具体信息。此外,各种
        

         
        
       
  • 课程背景
        定量技术的引入(SILAC、iTRAQ、TMT、label-free、MRM等),不但能知道样品中有什么蛋白质,同时又能对多组样品中的每一个蛋白质的表达水平进行相对/绝对的定量,有利于快速锁定目标分子,从而进行深入的生物学功能分析;(3)能直接对各种翻译后修饰进行鉴定与定量分析。
        通过LC-MS为基础的蛋白质组学技术,您可以进行差异蛋白质组学分析(筛选样本中差异表达的蛋白质)、相互作用分析(蛋白质与蛋白质、DNA、RNA、小分子等)和蛋白质翻译后修饰分析(甲基化、磷酸化、乙酰化等)等,能鉴定/定量成百上千个蛋白质/位点,拥有了专属于您的、样品特异性的蛋白质组数据库。问题:(1)在这么多的蛋白质中,如果锁定感兴趣的目标分子?(2)如何运用传统的生物学技术和方法对筛选到的目标分子进行细致的生物学功能分析,为文章添色,提高文章的档次?
    本课程将从LC-MS为基础的蛋白质组学技术原理出发,结合发表的学术文章,对目前的主流蛋白质组学技术进行详细讲解,旨在帮助学员深入理解蛋白质组学技术的原理、优势以及如何将蛋白质组学技术系统地整合到自己的课题设计和标书申请项目中。
        

         
        
       
  • 课程解决问题
    什么是蛋白质组和蛋白质组学?
    蛋白质组学的研究内容是什么?
    LC-MS进行蛋白质鉴定的具体原理
    1、LC的作用   2、MS数据采集
    数据库搜索(database search)如何完成蛋白质的鉴定?
    1、蛋白质组数据库资源及下载
    2、MS数据搜库及蛋白质鉴定
    2D-gel的技术原理
    结合文献,讲解2D-gel结合MALDI-TOF MS进行差异蛋白质组学分析方案
    1、样品类型及实验设计
    2、2D-gel分离及差异点筛选
    3、差异点MALDI-TOF MS鉴定
    4、差异蛋白质验证及功能分析
    结合文献,讲解免疫共沉淀(Co-IP)结合LC-MS进行蛋白质相互作用分析方案


  • 课程解决问题
    根据定量结果,筛选差异表达的蛋白质
    差异表达蛋白质的功能分析
    结合文献,讲解运用SILAC技术(super-SILAC)对人体病理组织进行差异比较定量蛋白质组学分析方案
    Super-SILAC的技术原理
    Super-SILAC实验设计
    Super-SILAC结合LC-MS对蛋白质样品进行鉴定与定量分析
    iTRAQ/TMT技术原理
    iTRAQ/TMT实验设计
    结合文献,讲解运用iTRAQ/TMT技术进行差异蛋白质组学分析方案
    1、iTRAQ/TMT实验设计及流程
    2、蛋白质LC-MS鉴定与定量
    3、定量数据分析,筛选差异表达蛋白
    4、差异表达蛋白质生物学方法(western blot、ELISA等)验证
    5、差异表达蛋白质功能解析
    Label-free定量蛋白质组学技术原理
    结合文献,讲解运用label-free技术进行差异蛋白质组分析


  • 课程解决问题
    1、免疫共沉淀实验设计
    2、免疫沉淀蛋白质复合物纯化
    3、差异条带切割、酶解及LC-MS鉴定
    4、蛋白质功能注释查询及目标分子筛选
    5、目标分子的生物学功能实验解析相互作用的分子机制
    SILAC定量蛋白质组学技术原理
    SILAC实验设计
    结合文献,讲解SILAC结合LC-MS进行细胞差异蛋白质组学分析方案
    1、实验设计及流程
    2、蛋白质LC-MS鉴定及定量分析
    3、根据定量结果,筛选差异表达的蛋白质(几百个)
    4、生物信息学(GO分类、pathway聚类等)分析差异表达的蛋白质
    5、生物学实验验证蛋白质组学数据
    结合文献,讲解SILAC结合免疫沉淀(Co-IP)和LC-MS进行蛋白质相互作用分析方案
    1、SILAC+Co-IP实验设计
    2、Co-IP纯化蛋白质复合物及SDS-PAGE分离
    3、蛋白质复合物LC-MS鉴定与定量


  • 注册费用:
    2400元/人。授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。
    按交费先后顺序确定座位号。提供午餐,晚餐自理。
    付款方式:
    A:银行转账
    账户名称:上海服淡信息科技有限公司     账户号:31578103002581719
    开户行:上海银行桃浦支行 
    B:支付宝转账
         收款人:wybiot@163.com     支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司
    联系方式:
    联系人:谢老师    手机号:13611825136 ;E-mail:azkj2012@163.com
    如您或您的学生计划参加请填写报名表并于报到前发送至联系人E-mail:azkj2012@163.com。为确保您已报名成功,请之后来电或者发短信予以确认。如有疑问,欢迎垂询!